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科学家发现没有可识别基因的病毒

病毒是地球上最神秘的生物之一。它们是世界上最小的生命形式之一,而且由于没有宿主就无法生存和繁殖,因此一些科学家质疑它们是否应该被视为生物。现在,科学家发现了一种无法识别的基因,使其成为所有已知病毒中最奇怪的一种。但是,我们真正知道多少种病毒?另一个小组刚刚发现了成千上万种新病毒,它们隐藏在数十种动物的组织中。

研究人员之一贝洛奥里藏特米纳斯吉拉斯州联邦大学的病毒学家JônatasAbrahão说,这些发现说明“我们仍然需要了解多少病毒”。

亚伯拉罕在寻找巨型病毒时发现了他的发现。这些微生物(大小与细菌相当)是在2003年的变形虫中首次发现的。在一个当地的人工湖中,他和他的同事们不仅发现了新的巨型病毒,而且发现了一种由于其体积小而与大多数细菌不同的病毒。在变形虫中感染。他们将其命名为Yaravirus。(根据土著图皮瓜拉尼神话,雅拉是“水之母”。)

雅拉病毒的大小并不是唯一奇怪的事情。该小组对基因组进行测序时,没有一个基因与任何科学家见过匹配,该小组在bioRxiv预印本服务器上报告。

病毒新颖性并不使纽约大学的Elodie Ghedin感到惊讶,他在废水和呼吸系统中寻找病毒。她说,污水数据中超过95%的病毒“与[数据库]中的参考基因组不匹配”。她说,就像亚伯拉罕一样,“我们似乎一直都在发现新病毒。”

亚伯拉罕说,雅拉病毒的某些基因看起来像是巨型病毒中的基因,但目前尚不清楚两者之间的关系。他和他的同事仍在研究这种新型病毒的生活方式的其他方面。

在亚伯拉罕(Abrahão)一次追逐病毒的同时,美国国家癌症研究所病毒学家克里斯托弗·巴克(Christopher Buck)和研究生迈克尔·提萨(Michael Tisza)正在建立更广泛的网络。他们在动物组织中广泛搜索是否使遗传物质围成一圈的病毒。所谓的环状病毒包括乳头瘤病毒,其中一种是人乳头瘤病毒,可引起宫颈癌,另一种通常对人无害。但是巴克有证据表明,后者可能与肾移植患者和其他人的膀胱癌有关。

为了找到这些病毒,研究人员从人类和其他动物的数十种组织样本中分离出病毒颗粒,并筛选了它们的环状基因组。该小组通过寻找一种编码病毒外壳的基因,证实了该DNA属于病毒。这些基因序列通常无法识别,但是Tisza编写了一个计算机程序,该程序预测哪些基因最有可能编码这些壳的独特折叠。

研究小组总共发现了大约2500种环状病毒,其中约600种是科学新病毒。研究小组在《eLife》中报告说,这些微生物对人类健康的影响(如果有的话)尚不清楚。但是巴克说,数据应该允许医生和科学家开始建立这些联系。该方法“是了解数百或数千个病毒基因组分布的重要工具,”Abrahão说。

这项新研究的意义不仅仅在于确定哪些病毒会引起疾病。某些生活在人体中的病毒可能有助于保持我们的健康,而另一些对于通过帮助回收必需营养素来保持生态系统的平稳运行至关重要。温哥华不列颠哥伦比亚大学的环境病毒学家Curtis Suttle说:“没有[他们],我们就无法生存。”他没有参与任何一项研究。“发现和表征病毒具有巨大的好处。”

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